繼中國多次以包裝驗出含COVID-19病毒為由，禁止台灣多款魚類冷凍產品進口後，澳門市政署前（29）日發出新聞稿表示，一批台灣芒果樣本的COVID-19病毒檢驗呈陽性，因此將20箱共100公斤重的芒果全數封存銷毁，並暫緩有關產品進口一星期。陸委會表示，澳府有關舉措已嚴重違反國際貿易規範，呼籲應秉科學精神，勿逕自阻礙商品流通及國際自由貿易。而台灣農委會和食藥署亦分別就事件回應，其中食藥署長吳秀梅強調，全球只有中國會對食品及其外包裝檢驗病毒，「若真的會造成危害，全球早已發出警訊」，指中國這種做法並不合理，應提出科學證據。
澳門市政署稱，在發現該批台灣進口芒果樣本COVID-19病毒檢測呈陽性後，隨即啟動應急預案，將該批貨物全數封存銷毁，並對存放芒果的周邊環境進行消毒，又稱該批芒果沒有流入市面。市政署重申，一直要求商號嚴格對進口食品外包裝作清潔消毒，並呼籲市民要勤洗手，共同做好防疫工作。
而澳門在6月18日起爆發新一波疫情，至今（1日）累計638宗感染COVID-19陽性個案，當地政府啟動多次全民PCR檢測。由於中國與澳門的口岸已實施通關隔離措施，因此嚴重打擊澳門的旅遊博奕行業，澳門6月份博奕毛收入僅約92億台幣（24.77億澳門元），是2020年10月疫情以來最差的一個月。
就進口澳門的台灣芒果被驗出COVID-19病毒，農委會防檢局植物檢疫組組長翁壹姿表示，輸出國通常會配合輸入國的要求，而針對植物只會視乎是否存在有害病蟲、生物進行檢驗。不過澳門並未要求台澳特定的病蟲害檢查，在一般性檢查、目視無病蟲害後，就會附上檢疫證明書並送往當地。她又稱，COVID-199病毒並非植物病害，如要反映相關狀況，澳門當局應通知衞福部。
至於陸委會亦對此事表達強烈關切，呼籲澳門政府應秉科學精神，勿逕自阻礙商品流通及國際自由貿易。陸委會表示，農委會已清楚說明，依目前科學研究，並未發現有病毒透過水果傳染人。針對中國大陸動輒以COVID-19為理由影響國際貿易，已有許多國家包含加拿大、歐盟、印度、美國透過WTO/SPS委員會提出關切。本次澳府循陸方無理作法，單方片面暫停進口我芒果進口，事前事後均未通知我方，陸委會呼籲，澳門當局所採進口食品之預防及監管措施，仍應有科學根據並符合國際規範，以維雙方貿易順暢。
