根據《鏡新聞》電視台報導，因為進口蛋爭議不斷，農業部長陳吉仲原本今天（9/17）下午要出席全國漁業團體賴清德後援會，卻臨時缺席，根據鏡新聞獨家掌握，陳吉仲已經請辭獲准。但截止今天傍晚18:30為止，行政院發言人林子倫被記者詢問時表示，針對這件事件，目前沒有任何回應，如有進一步消息，會再跟大家報告。
進口蛋爭議不斷，農業部長陳吉仲在神隱5天後，昨（16日）才親上火線公布流向，他說明強調，自己沒神隱，這幾天農業部都有以新聞稿回應，而根據統計，3到7月一共進口1億4千萬顆雞蛋，有3成多、大約5千4百萬顆耗損、到期封存銷毀，不會流入國內市場。
不過這說明似乎不夠，加上地方政府表示，曾向農業部索討資料以追查進口蛋流向，農業部卻說不方便給。
面對各項爭議，行政院今（17）日召集會議，指示農業部和衛福部盡速啟動聯合稽查，並提供各地方政府相關資料，徹查所有雞蛋流向、清查所有業者是否依法辦理。沒想到不久後就傳出陳吉仲請辭獲准消息，但截止今天傍晚18:30為止，這項消息尚未獲得行政院證實。
